La cuenca de Cointzio (650 km2) pertenece a la de Cuitzeo. Tiene un clima templado semi-húmedo con una estación lluviosa de junio a octubre.

En las planicies, se encuentran los Luvisoles con riego y una agricultura altamente mecanizada. En los pie de monte, los Acrisoles con moderada a baja mecanización considerada agricultura de sobrevivencia. En las partes altas Andosoles/Cambisoles cubiertos por bosques y algunos campos agrícolas. El sistema de manejo agrícola dominante es el de “año y vez” consistente en cultivar un año, seguido de un pastoreo extensivo. El ganado se encuentra disperso, sin control, y desde 2007, las plantaciones de aguacate con riego por goteo se han establecido en andosoles.